Antibiotiques pour l'acné - Étude pilote sur les dommages collatéraux sur le microbiome de la peau
Tiffany C. Scharschmidt JAMA Dermatol. 2019; 155 (4): 419-421.
Une décennie a passé depuis que les méthodes modernes de séquençage ont été utilisées pour étudier les communautés microbiennes présentes sur une peau saine et humaine. Ces études sur le microbiome cutané, terme qui englobe de manière générale les microorganismes résidents de la peau (bactéries, archées, champignons, virus) ainsi que leur contenu génomique et leurs sous-produits métaboliques, ont mis en lumière la diversité des microorganismes vivant à la surface de la peau et ont permis de renforcer la recherche comprendre leurs contributions à la santé et à la maladie humaines. L'attention portée par les médias non professionnels à la mise en lumière de ces enquêtes a sensibilisé le public et suscité son intérêt pour le microbiome humain. En clinique, cet intérêt se manifeste par un large éventail de demandes de patients concernant le rôle des micro-organismes dans les affections cutanées, l’influence des thérapies prescrites sur le microbiome et les stratégies ou produits visant à «optimiser» la flore cutanée pour la santé ou la cosmétique.3
Le rôle du microbiome cutané dans l'acné vulgaire intéresse particulièrement les patients, les cliniciens et les chercheurs. Cet intérêt découle en partie de l'opinion de longue date selon laquelle Cutibacterium (anciennement Propionibacterium ) acnes a un rôle causal dans la pathogenèse de l'acné et l'efficacité des antibiotiques topiques et oraux dans le traitement de l'acné. Plusieurs études ont maintenant utilisé des méthodes basées sur le séquençage pour profiler les souches de C acnes et la communauté bactérienne plus large de la peau associée à l’acné. Ensemble, ces profils ont mis en évidence des changements qualitatifs dans le microbiote cutané, c’est-à-dire une modification du contenu métagénomique ou de l’activité métabolique indiquée par des sous-ensembles spécifiques ou des ribotypes de C acnes qui semblent être associés à un risque plus d'acné que l' ensemble C acnes abondance.
Dans ce numéro de JAMA Dermatology , Chien et al 8 rapportent les résultats d’une petite étude pilote sur le microbiome de la peau du visage de 4 femmes acnéiques avant et après un traitement par minocycline par voie orale. L'analyse des prélèvements superficiels du front, de la joue et du menton bilatéraux a été réalisée au départ, après l'achèvement d'un traitement par minocycline d'un mois et de 1 à 8 semaines après l'achèvement du traitement aux antibiotiques. L'affectation taxonomique bactérienne a été réalisée par amplification et séquençage de la région hypervariable V3 / V4 du gène bactérien ribosomal 16S. Comme dans les études précédentes des sites de peau sébacée chez les participants sains et ceux souffrant d’acné, Chien et al ont constaté que Les acnés constituent une grande partie du microbiome facial. Tant au départ que pendant la période d'échantillonnage, la composition des échantillons d'un participant donné était très similaire à celle d'un participant différent. Cela concorde avec les données montrant que certains aspects du microbiome cutané sont hautement individualisés et que des souches spécifiques peuvent persister chez une personne donnée pendant des mois, voire des années.
Chez un participant donné, des changements dynamiques dans la composition de la communauté bactérienne ont été observés sur les 4 points de temps, suggérant potentiellement une pression de sélection induite par un antibiotique. L'analyse groupée des échantillons des 4 participants a révélé une réduction d'environ 25% de l'abondance relative de Acnes immédiatement après le traitement par la minocycline orale. Cette réduction a persisté à 1 semaine mais a été largement annulée à 1 mois après la thérapie. Fait important, la minocycline a également été associée à une diminution soutenue de l'abondance relative de plusieurs autres genres bactériens, à savoir Corynebacterium , Prevotella et plusieurs espèces de Lactobacillus , ainsi qu'à des augmentations temporaires ou durables d'autres (plusieurs Pseudomonas) et espèces de Streptococcus respectivement).
Comme les auteurs l'ont souligné à juste titre, la petite taille de l'échantillon, l'absence de groupe témoin non traité et l'omission des contrôles d'échantillonnage factice constituent des limites considérables qui limitent la possibilité de généralisation des résultats de leur étude. Cependant, l’échantillonnage longitudinal constitue l’un des points forts de l’étude et permet de mieux comprendre l’influence d’une intervention thérapeutique couramment utilisée. Les études qui utilisent cette conception fournissent des informations distinctes et complémentaires à celles qui étudient les communautés microbiennes associées à une maladie à un moment donné. Bien que l’ on s’attende à une réduction de l’abondance de C acnes à la suite d’un traitement par la minocycline, d’après des études antérieures utilisant le séquençage conventionnel des cultures 11 ou 16S, les modifications à court et à long terme d'autres genres bactériens intriguent et peuvent aider à expliquer les complications du traitement antibiotique de l'acné vulgaris, telles que la folliculite à Gram négatif et la pharyngite.
Il sera important de déterminer si les investigations futures décrivent des changements similaires dans la composition de la communauté bactérienne en réponse à la minocycline ou à d’autres traitements de l’acné et si ces changements sont en corrélation avec la réponse clinique décrite par Chien et al. 8 Il sera également intéressant d'associer ce type d'étude longitudinale et interventionnelle à des essais métagénomiques et protéomiques afin de détecter une altération de la capacité fonctionnelle du microbiome de la peau, telle que la prévalence de ribotypes spécifiques de C acnes, les îlots de «pathogénicité» et la production de produits apparentés. .
Indépendamment du statut de la maladie, cette étude contribue à un nombre réduit, mais croissant, de publications traitant de la composition et de la résilience du microbiome de la peau face aux agents antimicrobiens. Un examen récent de l'action à court terme d'antiseptiques topiques sur le dos et l'avant-bras de 13 participants en bonne santé a révélé que les effets du traitement dépendaient fortement de la composition initiale du microbiome bactérien, une caractéristique hautement personnalisée et spécifique au site corporel. De même, les différences de base dans la composition de microbiome des 4 individus évalués par Chien et al 8 peuvent avoir contribué aux trajectoires distinctes des communautés bactériennes, telle que mesurée par la diversité alpha, après le traitement de la minocycline.
Les futures études longitudinales devraient intégrer des algorithmes d'analyse et des calculs de taille d'échantillon tenant compte de ces différences spécifiques à la personne dans la composition de la communauté bactérienne cutanée. Des études sur les effets à long terme des antibiotiques par voie orale sur le microbiome intestinal au cours du traitement ont mis en évidence des modifications de la structure de la communauté bactérienne et de la prévalence de gènes de résistance aux antibiotiques qui persistent pendant des mois après le traitement. La récupération de la composition de la communauté intestinale est encore compromise par des traitements antibiotiques répétés. Il reste à déterminer si les antibiotiques oraux ont une influence relativement durable sur le microbiome cutané.
Les modifications à court terme de la structure et des fonctions du microbiome cutané ne se limitent probablement pas à une réponse aux agents antimicrobiens. En effet, de même que les communautés microbiennes intestinales sont influencées par le régime alimentaire (par exemple, faible vs riche en fibres), l'écologie microbienne de la peau est probablement influencée par des agents qui agissent sur les facteurs expliquant les différences de microbiome cutané spécifiques à l'âge et au site, telles que le contenu sébacé, salinité, pH et humidité. Tout traitement topique ou oral qui modifie ces paramètres et la communauté microbienne de la peau pourrait atténuer ou favoriser la maladie, selon le contexte. Bien que la perspective d'étudier tout l'éventail des produits pour la peau prescrits, en vente libre et légèrement réglementés ou non réglementés soit décourageante, nous pourrions accorder la priorité à l'étude des produits qui entraînent un bénéfice durable dans un contexte pathologique pertinent, comme l'isotrétinoïne dans l'acné. .
Comment pouvons-nous répondre aux questions de nos patients concernant le microbiome cutané? Je pense que nous pouvons être enthousiasmés par le potentiel des thérapies dérivées de microbes ou dirigées par des microbes en tant que futures armes de notre arsenal thérapeutique, tout en reconnaissant que nous ne comprenons toujours pas grand-chose de l’influence des thérapies actuelles sur la symbiose délicate que nous entretenons avec notre société. Dans le contexte d'un marché en croissance de produits en vente libre conçus pour «restaurer» le microbiome de la peau,
il convient de souligner qu'il n'existe pas de microbiome universellement bon ou mauvais pour la peau.
Les microbes jouent un rôle hautement contextuel dans la biologie de la peau, et divers facteurs, notamment la génétique de l'hôte, peuvent déterminer si une souche donnée contribue à la santé de l'hôte ou aggrave l'état pathologique. En tant que spécialité, la recherche fondamentale continue ainsi que les études translationnelles, telles que celles soulignées ici, nous placent dans une trajectoire solide pour déchiffrer ces complexités.
