Carnosine Vs virus?

[Nutrimuscle-Conseils]

Carnosine to Combat Novel Coronavirus (nCoV): Molecular Docking and Modeling to Cocrystallized Host Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2) and Viral Spike Protein
Loai M Saadah Molecules . 2020 Nov 28;25(23):5605.

Abstract
Aims: Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) plays an important role in the entry of coronaviruses into host cells. The current paper described how carnosine, a naturally occurring supplement, can be an effective drug candidate for coronavirus disease (COVID-19) on the basis of molecular docking and modeling to host ACE2 cocrystallized with nCoV spike protein.

Methods: First, the starting point was ACE2 inhibitors and their structure-activity relationship (SAR). Next, chemical similarity (or diversity) and PubMed searches made it possible to repurpose and assess approved or experimental drugs for COVID-19. Parallel, at all stages, the authors performed bioactivity scoring to assess potential repurposed inhibitors at ACE2. Finally, investigators performed molecular docking and modeling of the identified drug candidate to host ACE2 with nCoV spike protein.

Results: Carnosine emerged as the best-known drug candidate to match ACE2 inhibitor structure. Preliminary docking was more optimal to ACE2 than the known typical angiotensin-converting enzyme 1 (ACE1) inhibitor (enalapril) and quite comparable to known or presumed ACE2 inhibitors. Viral spike protein elements binding to ACE2 were retained in the best carnosine pose in SwissDock at 1.75 Angstroms. Out of the three main areas of attachment expected to the protein-protein structure, carnosine bound with higher affinity to two compared to the known ACE2 active site. LibDock score was 92.40 for site 3, 90.88 for site 1, and inside the active site 85.49.

Conclusion: Carnosine has promising inhibitory interactions with host ACE2 and nCoV spike protein and hence could offer a potential mitigating effect against the current COVID-19 pandemic.

[Nutrimuscle-Diététique]

Traduction de l'étude

La carnosine pour combattre le nouveau coronavirus (nCoV): amarrage moléculaire et modélisation vers l'enzyme 2 de conversion de l'angiotensine hôte cocristallisée (ACE2) et la protéine virale de pointe
Molécules de Loai M Saadah. 28 novembre 2020; 25 (23): 5605.

Abstrait
Objectifs: L'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) joue un rôle important dans l'entrée des coronavirus dans les cellules hôtes. Le présent article décrit comment la carnosine, un supplément naturel, peut être un candidat médicament efficace pour la maladie à coronavirus (COVID-19) sur la base de l'ancrage moléculaire et de la modélisation pour héberger ACE2 cocristallisé avec la protéine de pointe nCoV.

Méthodes: Tout d'abord, le point de départ était les inhibiteurs de l'ECA2 et leur relation structure-activité (SAR). Ensuite, la similarité chimique (ou la diversité) et les recherches PubMed ont permis de réutiliser et d'évaluer des médicaments approuvés ou expérimentaux pour COVID-19. Parallèlement, à tous les stades, les auteurs ont effectué un score de bioactivité pour évaluer les inhibiteurs potentiels réutilisés à ACE2. Enfin, les chercheurs ont effectué un ancrage moléculaire et une modélisation du candidat médicament identifié pour héberger ACE2 avec la protéine de pointe nCoV.

Résultats: La carnosine est devenue le candidat médicament le plus connu pour correspondre à la structure de l'inhibiteur de l'ACE2. L'arrimage préliminaire était plus optimal pour ACE2 que l'inhibiteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 1 (ACE1) typique connu (énalapril) et tout à fait comparable aux inhibiteurs de l'ECA2 connus ou présumés. Les éléments de protéine de pointe virale se liant à ACE2 ont été conservés dans la meilleure pose de carnosine dans SwissDock à 1,75 angströms. Sur les trois principaux domaines d'attachement attendus à la structure protéine-protéine, la carnosine s'est liée avec une affinité plus élevée à deux par rapport au site actif ACE2 connu. Le score LibDock était de 92,40 pour le site 3, 90,88 pour le site 1 et à l'intérieur du site actif de 85,49.

Conclusion: La carnosine a des interactions inhibitrices prometteuses avec l'hôte ACE2 et la protéine de pointe nCoV et pourrait donc offrir un effet atténuant potentiel contre la pandémie actuelle de COVID-19.