La COVID s'attaque à notre microbiote intestinal

[Nutrimuscle-Conseils]

Gut microbiota composition reflects disease severity and dysfunctional immune responses in patients with COVID-19
Yun Kit Yeoh GUT 2021

Objective Although COVID-19 is primarily a respiratory illness, there is mounting evidence suggesting that the GI tract is involved in this disease. We investigated whether the gut microbiome is linked to disease severity in patients with COVID-19, and whether perturbations in microbiome composition, if any, resolve with clearance of the SARS-CoV-2 virus.

Methods In this two-hospital cohort study, we obtained blood, stool and patient records from 100 patients with laboratory-confirmed SARS-CoV-2 infection. Serial stool samples were collected from 27 of the 100 patients up to 30 days after clearance of SARS-CoV-2. Gut microbiome compositions were characterised by shotgun sequencing total DNA extracted from stools. Concentrations of inflammatory cytokines and blood markers were measured from plasma.

Results Gut microbiome composition was significantly altered in patients with COVID-19 compared with non-COVID-19 individuals irrespective of whether patients had received medication (p<0.01). Several gut commensals with known immunomodulatory potential such as Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale and bifidobacteria were underrepresented in patients and remained low in samples collected up to 30 days after disease resolution. Moreover, this perturbed composition exhibited stratification with disease severity concordant with elevated concentrations of inflammatory cytokines and blood markers such as C reactive protein, lactate dehydrogenase, aspartate aminotransferase and gamma-glutamyl transferase.

Conclusion Associations between gut microbiota composition, levels of cytokines and inflammatory markers in patients with COVID-19 suggest that the gut microbiome is involved in the magnitude of COVID-19 severity possibly via modulating host immune responses. Furthermore, the gut microbiota dysbiosis after disease resolution could contribute to persistent symptoms, highlighting a need to understand how gut microorganisms are involved in inflammation and COVID-19.

[Nutrimuscle-Diététique]

Traduction de l'étude

La composition du microbiote intestinal reflète la gravité de la maladie et les réponses immunitaires dysfonctionnelles chez les patients atteints de COVID-19
Kit Yun Yeoh GUT 2021

Objectif Bien que le COVID-19 soit principalement une maladie respiratoire, il existe de plus en plus de preuves suggérant que le tube digestif est impliqué dans cette maladie. Nous avons examiné si le microbiome intestinal est lié à la gravité de la maladie chez les patients atteints de COVID-19, et si les perturbations dans la composition du microbiome, le cas échéant, se résolvent avec la clairance du virus SRAS-CoV-2.

Méthodes Dans cette étude de cohorte de deux hôpitaux, nous avons obtenu le sang, les selles et les dossiers des patients de 100 patients atteints d'une infection par le SRAS-CoV-2 confirmée en laboratoire. Des échantillons de selles en série ont été prélevés sur 27 des 100 patients jusqu'à 30 jours après l'élimination du SRAS-CoV-2. Les compositions de microbiome intestinal ont été caractérisées par un séquençage de l'ADN total extrait des selles. Les concentrations de cytokines inflammatoires et de marqueurs sanguins ont été mesurées à partir du plasma.

Résultats La composition du microbiome intestinal a été significativement modifiée chez les patients atteints de COVID-19 par rapport aux individus non-COVID-19, que les patients aient ou non reçu des médicaments (p <0,01). Plusieurs commensaux intestinaux ayant un potentiel immunomodulateur connu, tels que Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale et bifidobactéries, étaient sous-représentés chez les patients et restaient faibles dans les échantillons prélevés jusqu'à 30 jours après la résolution de la maladie. De plus, cette composition perturbée présentait une stratification avec une gravité de la maladie concordante avec des concentrations élevées de cytokines inflammatoires et de marqueurs sanguins tels que la protéine C réactive, la lactate déshydrogénase, l'aspartate aminotransférase et la gamma-glutamyl transférase.

Conclusion Les associations entre la composition du microbiote intestinal, les niveaux de cytokines et les marqueurs inflammatoires chez les patients atteints de COVID-19 suggèrent que le microbiome intestinal est impliqué dans l'ampleur de la gravité du COVID-19, éventuellement via la modulation des réponses immunitaires de l'hôte. En outre, la dysbiose du microbiote intestinal après la résolution de la maladie pourrait contribuer à des symptômes persistants, soulignant la nécessité de comprendre comment les micro-organismes intestinaux sont impliqués dans l'inflammation et le COVID-19.