Criblage virtuel de vitamine contre la protéase COVID-19?

[Nutrimuscle-Conseils]

Virtual screening and repurposing of FDA approved drugs against COVID-19 main protease
Mahmoud Kandeel Life Sciences Volume 251, 15 June 2020, 117627

Aims
In December 2019, the Coronavirus disease-2019 (COVID-19) virus has emerged in Wuhan, China. In this research, the first resolved COVID-19 crystal structure (main protease) was targeted in a virtual screening study by of FDA approved drugs dataset. In addition, a knowledge gap in relations of COVID-19 with the previously known fatal Coronaviruses (CoVs) epidemics, SARS and MERS CoVs, was covered by investigation of sequence statistics and phylogenetics.

Materials and methods
Molecular modeling, virtual screening, docking, sequence comparison statistics and phylogenetics of the COVID-19 main protease were investigated.

Key findings
COVID-19 Mpro formed a phylogenetic group with SARS CoV that was distant from MERS CoV. The identity% was 96.061 and 51.61 for COVID-19/SARS and COVID-19/MERS CoV sequence comparisons, respectively. The top 20 drugs in the virtual screening studies comprised a broad-spectrum antiviral (ribavirin), anti-hepatitis B virus (telbivudine), two vitamins (vitamin B12 and nicotinamide) and other miscellaneous systemically acting drugs. Of special interest, ribavirin had been used in treating cases of SARS CoV.


Significance
The present study provided a comprehensive targeting of the first resolved COVID+19 structure of Mpro and found a suitable save drugs for repurposing against the viral Mpro. Ribavirin, telbivudine, vitamin B12 and nicotinamide can be combined and used for COVID treatment. This initiative relocates already marketed and approved safe drugs for potential use in COVID-treatment.

[Nutrimuscle-Conseils]

Among antivirals, ribavirin and telbivudine were ranked at the second and third positions. They showed 2 folds increase in the docking scores, compared with curcumin. Vitamin B12 and nicotinamide were ranked at the 4th and 6th positions.

[Nutrimuscle-Conseils]

After a virtual screening capmain against COVID-19 Mpro, a set of antivirals, vitamins, antimicrobials, and other systemically acting drugs were more potent binding with COVID-19 Mpro, compared with curcumin (known Mpro inhibitor). The repurposing of ribavirin, telbivudine, vitamin B12 and nicotinamide is suggested.

[Nutrimuscle-Diététique]

Traduction de l'étude

Criblage virtuel et réutilisation de médicaments approuvés par la FDA contre la principale protéase COVID-19
Mahmoud Kandeel Life Sciences Volume 251, 15 juin 2020, 117627

Objectifs
En décembre 2019, le virus Coronavirus disease-2019 (COVID-19) a fait son apparition à Wuhan, en Chine. Dans cette recherche, la première structure cristalline COVID-19 résolue (protéase principale) a été ciblée dans une étude de criblage virtuelle par un ensemble de données sur les médicaments approuvés par la FDA. En outre, une enquête sur les statistiques de séquence et la phylogénétique a permis de combler une lacune dans les relations entre le COVID-19 et les épidémies mortelles de coronavirus (CoV) connues précédemment, le SRAS et le MERS.

matériaux et méthodes
La modélisation moléculaire, le criblage virtuel, l'amarrage, les statistiques de comparaison de séquences et la phylogénétique de la principale protéase COVID-19 ont été étudiés.

Principales conclusions
COVID-19 Mpro a formé un groupe phylogénétique avec SARS CoV qui était éloigné de MERS CoV. Le pourcentage d'identité était de 96,061 et 51,61 pour les comparaisons de séquences COVID-19 / SARS et COVID-19 / MERS CoV, respectivement. Les 20 principaux médicaments des études de dépistage virtuel comprenaient un antiviral à large spectre (ribavirine), un virus anti-hépatite B (telbivudine), deux vitamines (vitamine B12 et nicotinamide) et d'autres médicaments à action systémique divers. D'un intérêt particulier, la ribavirine a été utilisée dans le traitement des cas de SRV CoV.


Importance
La présente étude a fourni un ciblage complet de la première structure COVID + 19 résolue de Mpro et a trouvé un médicament de sauvegarde approprié pour une réutilisation contre le Mpro viral. La ribavirine, la telbivudine, la vitamine B12 et la nicotinamide peuvent être combinées et utilisées pour le traitement COVID. Cette initiative délocalise des médicaments sûrs déjà commercialisés et approuvés pour une utilisation potentielle dans le traitement par COVID. Parmi les antiviraux, la ribavirine et la telbivudine ont été classés aux deuxième et troisième positions. Ils ont montré une augmentation de 2 fois des scores d'amarrage par rapport à la curcumine. La vitamine B12 et le nicotinamide ont été classés aux 4e et 6e positions. curcumine (inhibiteur connu du Mpro). La réutilisation de la ribavirine, de la telbivudine, de la vitamine B12 et de la nicotinamide est suggérée.