La génétique explique la variabilité des effets des oméga 3

[Nutrimuscle-Conseils]

Prevention of Potential Adverse Metabolic Effects of a Supplementation with Omega-3 Fatty Acids Using a Genetic Score Approach
Franck M. Lifestyle Genomics 2019

Introduction:
The consumption of long-chain omega-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFA) has been reported to have beneficial health effects, notably, by reducing plasma triglyceride levels. Nonetheless, a concomitant decrease in insulin sensitivity has also been observed, but is highly variable among subjects.

Herein, we aimed to determine the importance of the genetic background in the interindividual variability of the insulin sensitivity response following an n-3 PUFA supplementation.

Methods: A total of 210 participants completed a 6-week n-3 PUFA supplementation with 5 g/day of fish oil (providing 1.9–2.2 g of eicosapentaenoic acid + 1.1 g of docosahexaenoic acid). Insulin resistance was estimated by the homeostatic model assessment (HOMA-IR), and participants were further classified as high-risk or low-risk depending on their HOMA-IR change following the n-3 PUFA supplementation, as compared to pre-supplementation values. Genome-wide genotyping data were obtained for 138 participants using HumanOmni-5-Quad BeadChips containing 4,301,331 single nucleotide polymorphisms. A genome-wide association analysis (GWAS) was carried out between high-risk and low-risk participants. The population study was split into training (60%) and testing (40%) datasets to assess the predictive accuracy of a genetic risk score (GRS) constructed by summing the number of risk alleles.

Results: Following the n-3 PUFA supplementation, 32 participants had increased HOMA-IR as compared to initial values and were classified as high risk (23.2%), whereas remaining subjects were classified as low risk (n = 106, 76.8%). A total of 8 loci had frequency differences between high-risk and low-risk participants at a suggestive GWAS association threshold (p value <1 × 10–5). After applying 10-fold cross validation, the GRS showed a significant association with the risk of increased HOMA-IR in the testing dataset (OR = 3.16 [95% CI, 1.85–7.14]), with a predictive accuracy of 0.85, and explained 40% of variation in HOMA-IR change.

Conclusions: These results suggest that the genetic background has a relevant role in the interindividual variability observed in the insulin sensitivity response following an n-3 PUFA supplementation. Subjects being at risk of insulin sensitivity lowering following an n-3 PUFA supplementation may be identified using genetic-based precision nutrition approaches.

[Nutrimuscle-Diététique]

Prévention des effets métaboliques indésirables potentiels d'une supplémentation en acides gras oméga-3 à l'aide d'une approche par score génétique
Franck M. Lifestyle Génomique 2019

Introduction :
La consommation d'acides gras polyinsaturés oméga-3 à longue chaîne (AGPI n-3) aurait des effets bénéfiques sur la santé, notamment en réduisant les concentrations plasmatiques de triglycérides. Néanmoins, une diminution concomitante de la sensibilité à l'insuline a également été observée, mais est très variable selon les sujets.

Ici, notre objectif était de déterminer l’importance du contexte génétique dans la variabilité interindividuelle de la réponse de sensibilité à l’insuline à la suite d’une supplémentation en oméga 3.

Méthodes: Au total, 210 participants ont complété une supplémentation en oméga 3 de 6 semaines avec 5 g / jour d'huile de poisson (apportant 1,9 à 2,2 g d'acide eicosapentaénoïque + 1,1 g d'acide docosahexaénoïque). La résistance à l'insuline a été estimée par l'évaluation du modèle homéostatique (HOMA-IR), puis les participants ont été classés dans la catégorie de risque élevé ou faible en fonction de leur changement HOMA-IR après la supplémentation en oméga 3, par rapport aux valeurs antérieures à la supplémentation. . Des données de génotypage à l'échelle du génome ont été obtenues pour 138 participants à l'aide de beadChips HumanOmni-5-Quad contenant 4 301 331 polymorphismes de nucléotide simple. Une analyse d'association pangénomique (GWAS) a été réalisée entre des participants à haut risque et à faible risque. L'étude sur la population a été scindée en ensembles de données sur la formation (60%) et sur le test (40%) afin d'évaluer l'exactitude prédictive d'un score de risque génétique (GRS) construit en faisant la somme du nombre d'allèles à risque.

Résultats: Suite à la supplémentation en oméga 3, 32 participants ont présenté une augmentation de HOMA-IR par rapport aux valeurs initiales et ont été classés en risque élevé (23,2%), tandis que les sujets restants ont été classés en risque faible (n = 106, 76,8%). Un total de 8 loci présentait des différences de fréquence entre les participants à risque élevé et les participants à risque faible à un seuil d'association GWAS évocateur (valeur p <1 × 10–5). Après application d'une validation croisée de 10 fois, le GRS a montré une association significative avec le risque d'augmentation de HOMA-IR dans l'ensemble de données de test (OR = 3.16 [IC 95%, 1.85–7.14]), avec une précision prédictive de 0,85, et a expliqué 40% de variation du changement HOMA-IR.

Conclusions: Ces résultats suggèrent que le contexte génétique joue un rôle important dans la variabilité interindividuelle observée dans la réponse de sensibilité à l'insuline après une supplémentation en oméga 3. Les sujets à risque de diminution de la sensibilité à l'insuline après une supplémentation en oméga 3 peuvent être identifiés à l'aide d'approches de nutrition de précision à base génétique.