Inulin, le microbiome intestinal et le souffle profond des patients asthmatiques - Nouvelles voies de traitement de l'asthme
Corinna Ulrike Brehm j.ebiom.2019.07.052
Les modes de vie occidentalisés modernes ont changé les attitudes et les conditions de la santé humaine à bien des égards. La comparaison du microbiote intestinal de tribus autochtones isolées telles que les Yanomami d’Amazonie avec celles de sujets occidentalisés souligne ce constat, en illustrant de manière frappante le fait que ces changements affectent même les conditions physiologiques fondamentales [ 1]. La co-évolution phylogénétique de l'homme et des microbes a conduit à un microbiote symbiotique divers et bénéfique à la surface des muqueuses de l'hôte. Les Yanomami, avec leur style de vie primitif proche de la nature, représentent une manifestation ancestrale, jusque-là conservée, de cette communauté microbienne à variantes multiples.
En revanche, le microbiote des sujets occidentalisés manque significativement de cette diversité. De nombreux facteurs déterminent le microbiome intestinal des indigènes, notamment les habitudes alimentaires. En examinant de plus près le spectre des nutriments de chasseurs-cueilleurs semi-nomades comme le Yanomami, des fruits, des racines et des légumes riches en fibres ont constitué le corps de base de la nutrition quotidienne. Les plantes, comme le manioc, les plantains et les patates douces, contiennent de grandes quantités d’inuline, un oligosaccharide de fructose.
Comparé au spectre alimentaire des Yanomami, le régime alimentaire moderne se caractérise par une faible teneur en aliments riches en fibres. La diminution de la consommation de produits à haute teneur en fibres et l'augmentation concomitante de maladies auto-immunes et allergiques dans les sociétés industrielles ont donné lieu à l'hypothèse qu'il pourrait exister une relation de cause à effet entre ces observations [ 3 ]. Partant de l’hypothèse que l’homéostasie intestinale joue un rôle fondamental dans la tolérance immunitaire, l’épuisement et la perturbation des communautés microbiennes intestinales peuvent conduire à une déviation immunitaire qui favorise les affections inflammatoires chroniques dans l’intestin et dans l’ensemble du corps. Un certain nombre d'études récentes soutiennent cet «axe alimentation – microbiote – intestin – immunitaire» [ 4].
L'inuline agit comme un puissant stimulant pour la croissance du genre bénéfique Bifidobacterium dans le microbiote intestinal, tout en maintenant à un faible niveau les pathogènes potentiels tels que Salmonella et Clostridia [ 5 ]. Diverses bactéries intestinales, y compris Bifidobacterium, dégradent l'inuline en butyrate et en autres acides gras courts offrant de nombreux avantages pour la santé [ 6]. Ces produits de fermentation sont capables d’agir en tant qu’inhibiteurs de l’histone déctétylase (HDAC) et de se lier aux récepteurs couplés à la protéine G (GPCR) situés à la surface extérieure des cellules épithéliales. Il a été démontré que les GPCR étaient impliqués dans l'activation des lymphocytes T régulateurs (Treg), ainsi que dans le maintien de l'intégrité épithéliale et de l'homéostasie intestinale. L'absence de cette détection métabolique peut entraîner une suppression des sous-ensembles de Treg et une perte de contrôle des populations de cellules T auxiliaires 2 responsables de maladies allergiques [ 7 ].
Comme nous ne pouvons pas transformer nos habitudes alimentaires de l'âge de l'espace à l'âge de pierre, de nouvelles stratégies sophistiquées doivent être utilisées, qui respectent ces données, afin de développer des traitements de meilleure qualité et bien adaptés aux maladies inflammatoires chroniques. Cette postulation est par conséquent abordée dans l'essai à court terme mené par McLoughlin et al. et publié dans EBioMedicine [ 8 ]. Dans un traitement de sept jours chez des patients asthmatiques avec l'inuline prébiotique à fibres solubles, ils visaient à évaluer les bénéfices sur les paramètres cliniques d'asthme, les impacts sur la composition du microbiote intestinal et les biomarqueurs démontrant la dégradation de l'inuline et la modification immunitaire.
L'étude contrôlée par placebo révèle plusieurs résultats remarquables [ 8 ]. Tout d'abord, il est frappant de constater que les éosinophiles présents dans les expectorations, caractéristique fondamentale de l'asthme allergique, ont été considérablement réduits lors de la supplémentation en inuline. Du point de vue des patients, il est encore plus pertinent que le traitement par inuline améliore le contrôle de l'asthme. Fait intéressant, il a été démontré que les suppléments de fibres présentaient un avantage notable chez les patients allergiques présentant une forte proportion d’éosinophiles dans les expectorations, et en particulier ceux dont l’asthme était mal contrôlé. L'inhibition de HDAC9 après la supplémentation en inuline suggère une voie mécanistique qui pourrait être importante dans ce contexte.
Deuxièmement, l'étude révèle que la consommation à court terme d'une fibre soluble seule est capable de modifier considérablement le microbiote intestinal, tandis que la consommation simultanée de bactéries dégradant l'inuline n'a pas amélioré ce résultat. À première vue, ce résultat semble surprenant. Cependant, il est connu que le microbiote intestinal héberge un certain nombre de souches bactériennes qui peuvent immédiatement activer les voies métaboliques pour utiliser l'inuline comme source de carbone et stimuler ainsi la croissance bactérienne d'autres espèces [ 9]. Cette capacité métabolique de la communauté intestinale microbienne semble être plus adaptative qu'une colonisation de novo par des souches probiotiques digérées. En conséquence, les auteurs s’attendaient à détecter une augmentation du nombre d’acides gras à chaîne courte (SCFA), un produit de cette activité bactérienne métabolique, dans le plasma des sujets traités à l’inuline, mais n’ont pas pu vérifier cette hypothèse. Dans le plasma, les acides gras libres sont soumis à un renouvellement métabolique rapide et le moment de la collecte de l'échantillon peut ne pas avoir été approprié.
Cette étude constitue un premier pas vers de nouvelles approches holistiques visant à améliorer les paramètres cliniques, le contrôle de l'asthme et, éventuellement, d'autres maladies inflammatoires chroniques. Cependant, il est encore douteux qu'une intervention à court terme avec des composants diététiques riches en fibres soit suffisamment efficace pour révéler des résultats durables. Dans les essais à venir, des plans d’études préventives et à long terme sont nécessaires pour prouver le potentiel, ainsi que les limites, de la supplémentation en fibres dans les maladies allergiques. Un retour sur les modes de vie anciens et primitifs pourrait nous inciter à développer de nouvelles stratégies innovantes de lutte contre les maladies inflammatoires chroniques.