Étudier le lien de causalité possible entre la consommation de café et le risque d'arthrose à l'aide d'une analyse de randomisation mendélienne
Young Ho Lee Rhumatologie Clinique Novembre 2018, Volume 37, Numéro 11 , pp 3133–3139
Cette étude a examiné si la consommation de café est causalement associée à l'arthrose. Une analyse par randomisation mendélienne (MR) à deux échantillons utilisant des estimations de la médiane pondérée en fonction de la variance inverse (IVW) et pondérée, ainsi que la méthode de régression MR-Egger ont été réalisées. Les ensembles de données statistiques sommaires accessibles au public sur les méta-analyses d’études d’association génomique de consommation de café (GWAS) sur la consommation de café de huit cohortes de race blanche ( n = 18 176), ainsi que sur des méta-analyses GWAS de consommateurs de café de type essentiellement régulier d’origine européenne ( n= jusqu’à 91 462) et un test GWAS chez 7410 patients souffrant d’arthrose dans l’étude arcOGEN avec 11 009 témoins d’ascendance européenne ont été évalués. Quatre polymorphismes mononucléotidiques (SNP) issus de GWAS de la consommation de café en tant que variables instrumentales (IV) pour améliorer l'inférence ont été sélectionnés. Ces SNP étaient situés au niveau de la neurocalcin delta (NCALD) (rs16868941), de la cytochrome p450 oxydoréductase (POR) (rs17685), du cytochrome p450 de la sous-famille A (1) (CYP1A1) (RS2470893) et de la molécule d’adhésion de cellules neuronales . La méthode IVW (beta = 0,381, SE = 0,170, p = 0,025) et l’approche médiane pondérée (beta = 0,419, SE = 0,206, p = 0,047) a montré des preuves à l'appui d'une association de cause à effet entre la consommation de café et l'arthrose. La régression MR-Egger a révélé que la pléiotropie directionnelle ne biaisait probablement pas le résultat (intercept = 0,064; p = 0,549), mais ne montrait aucune association de cause à effet entre la consommation de café et l'arthrose (bêta = - 0,518, SE = 1,270, p = 0,723). Le test Q de Cochran et le graphique en entonnoir n'indiquent aucune preuve d'hétérogénéité entre les estimations IV basées sur les variants individuels. Les résultats de l'analyse par résonance magnétique corroborent l'observation selon laquelle la consommation de café est associée de manière causale à un risque accru d'arthrose.
