L'analyse unicellulaire dissèque les effets de la vitamine D sur les signatures génétiques de sénescence dans les tissus murins
par Emilio Sosa-Díaz Nutrients 2025, 17(3), 429 ;
Contexte/Objectifs : La vitamine D (VD) joue un rôle crucial dans les maladies liées à l'âge, et son influence sur la sénescence cellulaire (CS) pourrait aider à clarifier sa fonction dans le vieillissement. Considérant les effets pléiotropiques de la VD et l'hétérogénéité de la CS. Méthodes : nous avons utilisé le séquençage d'ARN unicellulaire (scRNA-seq) pour explorer cette dynamique dans plusieurs tissus. Nous avons analysé trois ensembles de données de tissus murins (os, prostate et peau) obtenus à partir de référentiels publics, enrichissant les signatures génétiques de sénescence. Nous avons ensuite déduit des réseaux de régulation des gènes (GRN) au niveau des tissus et des types de cellules et effectué deux analyses de communication cellulaire : une pour les cellules sénescentes et une autre pour les interactions entre les cellules sénescentes et non sénescentes. Résultats : La supplémentation en VD a significativement diminué les scores de sénescence dans la peau (p = 3,96×10−134
) et la prostate (p = 1,56×10−34). L’analyse GRN de la prostate a révélé une relation régulatrice altérée entre les macrophages et les fibroblastes. Dans les os, des modules distincts liés au vieillissement ont émergé pour différentes lignées osseuses. Dans la peau, des schémas de différenciation contraires entre les cellules suprabasales et basales ont été observés.
Les principales voies modulées par VD étaient impliquées dans l’inflammation, le remodelage de la matrice extracellulaire, le métabolisme des protéines et la traduction. VD a réduit les interactions fibroblastes-macrophages dans la prostate et la peau, mais a augmenté la diaphonie cellulaire globale dans les os.
Conclusions : Nos résultats démontrent que VD allège la charge de CS dans les tissus en modulant l’inflammation et les processus métaboliques et en favorisant la différenciation. Les gènes clés liés au vieillissement modulés par VD étaient liés à l’anabolisme et à la différenciation cellulaire, suggérant le potentiel de VD pour les interventions thérapeutiques ciblant les maladies liées à l’âge.
