Traduction de l'étude
Métabolites avec activité inhibitrice du SRAS-CoV-2 identifiés à partir de commensaux du microbiome humain
mSphere 01 décembre 2021 Auteurs : Frank J. Piscotta,
La pandémie de COVID-19 a mis en évidence la nécessité d'identifier des petites molécules antivirales supplémentaires pour compléter les thérapies existantes. Bien que de plus en plus de preuves suggèrent que les métabolites produits par le microbiome humain ont des activités biologiques diverses, leurs propriétés antivirales restent peu explorées. À l'aide d'un test d'infection cellulaire par le SRAS-CoV-2, nous avons criblé des extraits de bouillon de culture d'une collection de bactéries phylogénétiquement diverses associées à l'homme pour la production de petites molécules à activité antivirale. Le fractionnement guidé par essai biologique a découvert trois métabolites bactériens capables d'inhiber l'infection par le SRAS-CoV-2. Cela comprenait l'analogue nucléosidique N6-(Δ2-isopentényl)adénosine, l'agoniste du récepteur 5-hydroxytryptamine tryptamine et la pyrazine 2,5-bis(3-indolylméthyl)pyrazine. La plus puissante d'entre elles, la N6-(Δ2-isopentényl)adénosine, avait une concentration inhibitrice de 50 % (CI50) de 2 μM.
Ces composés antiviraux naturels présentent des similitudes structurelles et fonctionnelles avec les médicaments synthétiques qui ont été cliniquement examinés pour une utilisation contre COVID-19. Notre découverte de métabolites structurellement divers avec une activité anti-SRAS-CoV-2 à partir du dépistage d'une petite fraction des bactéries signalées comme étant associées au microbiome humain suggère que l'exploration continue de bactéries phylogénétiquement diverses associées à l'homme est susceptible de découvrir de petites molécules supplémentaires qui inhiber le SRAS-CoV-2 ainsi que d'autres infections virales.
IMPORTANCE La prévalence continue de COVID-19 et l'émergence de nouvelles variantes ont une fois de plus mis en lumière la nécessité d'identifier les antiviraux SARS-CoV-2. Le microbiome humain produit une gamme de petites molécules avec des bioactivités (par exemple, des ligands du récepteur hôte), mais sa capacité à produire de petites molécules antivirales est relativement sous-explorée. Ici, à l'aide d'une plate-forme de dépistage cellulaire, nous décrivons l'isolement de trois métabolites dérivés du microbiome capables de prévenir l'infection par le SRAS-CoV-2 in vitro. Ces molécules présentent des similitudes structurelles avec les drogues synthétiques qui ont été explorées pour le traitement du COVID-19, et ces résultats suggèrent que le microbiome peut être une source fructueuse de découverte de petites molécules ayant des activités antiviral
Association élevée de la gravité du COVID-19 avec un mauvais score de santé intestinale chez les patients libanais
Imad Al Kassaa PLoS One. 21 octobre 2021;16(10):e0258913.
Contexte : La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a touché des millions de vies dans le monde. Cependant, la maladie a présenté des défis plus extrêmes pour les pays en développement qui connaissent des crises économiques. Les études sur les symptômes du COVID-19 et la santé intestinale sont rares et n'ont pas entièrement analysé les associations possibles entre la santé intestinale et la physiopathologie de la maladie. Par conséquent, cette étude visait à démontrer une association potentielle entre la santé intestinale et la gravité du COVID-19 dans la communauté libanaise, qui traverse une grave crise économique.
Méthodes : Cette étude transversale a examiné des patients libanais positifs pour le SRAS-CoV-2 PCR. Les participants ont été interrogés et la santé intestinale, les symptômes du COVID-19 et différentes métriques ont été analysés à l'aide de modèles de régression logistique simples et multiples.
Résultats : L'analyse des données a montré que 25 % des participants étaient asymptomatiques, tandis qu'une proportion égale a présenté des symptômes graves, notamment une dyspnée (22,7 %), un besoin en oxygène (7,5 %) et une hospitalisation (3,1 %). L'âge moyen des participants était de 38,3 ± 0,8 ans, et la majorité étaient des hommes (63,9 %), mariés (68,2 %) et actuellement employés (66,7 %). Une corrélation négative a été trouvée entre le score de santé intestinale et les symptômes du COVID-19 (tau-b de Kendall = -0,153, P = 0,004) ; indiquant qu'une mauvaise santé intestinale était associée à des cas de COVID-19 plus graves. De plus, les participants qui ont signalé un apport alimentaire malsain étaient plus susceptibles de présenter des symptômes graves (tau-b de Kendall = 0,118, P = 0,049). Lorsque tous les éléments ont été pris en considération, plusieurs modèles de régression logistique ordinale ont montré une association significative entre les symptômes du COVID-19 et chacune des variables suivantes : statut de travail, épisodes de syndrome grippal et score de santé intestinale. Les symptômes graves de COVID-19 étaient plus fréquents chez les patients ayant des scores de santé intestinale médiocres (OR:1,31, IC à 95 %:1,07-1,61 ; P = 0,008), connaissant plus d'un épisode de syndrome grippal par an (OR :2,85, IC à 95 % : 1,58-5,15 ; P = 0,001) et avoir un emploi (OR : 2,00, IC à 95 % : 1,1 à 3,65 ; P = 0,023).
Conclusions : À notre connaissance, il s'agit de la première étude qui a montré l'impact de la santé intestinale et de l'exposition aux virus respiratoires sur la gravité du COVID-19 au Liban. Ces résultats peuvent faciliter la lutte contre la pandémie au Liban.
Un microbiote intestinal altéré et un intestin qui fuit associé affectent-ils la gravité du COVID-19 ?
Heenam Stanley mBio. 2021 janvier-février ; 12(1) : e03022-20.
La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), qui a été déclarée pandémie, a présenté un large éventail de gravité dans le monde entier. Bien que cette variation mondiale soit largement affectée par les situations socio-médicales de chaque pays, il existe également une forte variation au niveau individuel attribuable à la vieillesse et à certaines conditions médicales sous-jacentes, notamment l'hypertension artérielle, le diabète et l'obésité. Étant donné que la vieillesse et les affections chroniques susmentionnées sont souvent associées à un microbiote intestinal altéré, entraînant une perturbation de l'intégrité de la barrière intestinale, et que les symptômes intestinaux ont toujours été associés à une maladie plus grave chez les patients COVID-19, il est possible que le dysfonctionnement de l'intestin soit un tout influence la gravité du COVID-19. Cet article résume les preuves accumulées qui soutiennent l'hypothèse selon laquelle un microbiote intestinal altéré et son intestin qui fuit associé peuvent contribuer à l'apparition de symptômes gastro-intestinaux et parfois à des complications multiviscérales supplémentaires pouvant conduire à une maladie grave en permettant la fuite du coronavirus responsable dans le système circulatoire. système.
MESSAGES CLÉ
Bien que ce qui suit reste à démontrer empiriquement, l'accumulation de preuves soutient l'hypothèse qu'un microbiote intestinal altéré et un intestin qui fuit associé peuvent contribuer à l'apparition de symptômes gastro-intestinaux liés à la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), tels que la diarrhée et, dans les cas graves. cas, complications multiviscérales.
Le dépistage d'un intestin qui fuit et des charges virales fécales et plasmatiques peut être utile pour diagnostiquer les personnes gravement malades ou pour prévenir la transmission par excrétion fécale du virus.
La transplantation de microbiote fécal (FMT), les probiotiques de nouvelle génération axés sur les microbes intestinaux producteurs de butyrate ou simplement l'augmentation de l'apport quotidien de fibres alimentaires peuvent être envisagés pour améliorer la santé intestinale des patients atteints de COVID-19.